現行的濕巾生產過程基本分為五個步驟：
I)配制將防腐劑、香精和水、護膚劑等按照比例配制，如果是衛生濕毛巾，還需加入消毒劑；
2)攪拌將配制好的液體混合攪拌均勻；
3)浸泡把干巾或干毛巾持續浸泡在液體中一定時間；
4)浙干將濕巾浙干至規定重量；
5)包裝折疊濕巾裝入包裝袋封口。如果是連續化生產則將配制好的液體噴灑在巾體上，隨后加以包裝。 

 如果濕巾長期被放置在潮濕、悶熱、不通風的倉庫里，尤其梅雨季節，適宜的溫濕度會使真菌繁殖，打開包裝袋可以看見在白色的濕巾上有黑色或是深綠色、紫色或者黃色的霉斑，同時還能聞到令人不愉快的霉味。

由于濕巾的防腐防霉難度大，以往國內不少濕巾生產企業均曾發生過由于濕巾微生物嚴重超標、發臭霉變而造成損失的情況。為了防止濕巾上微生物的繁殖，許多企業都采用在配制液里添加防腐劑的方式以確保產品在保質期內符合衛生。

但是，由于目前對濕巾添加的防腐劑并未作種類和限用量的規定，一些企業為了濕巾微生物指標符合要求，往往任意使用各種防腐劑或加大防腐劑濃度，這樣微生物指標雖然得到了控制，但隱藏在深處的危害卻極大地威脅著消費者的健康，尤其是一些毒性大、對皮膚刺激強的防腐劑常會造成使用者臉部皮膚過敏或其它不適。